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教授

工学博士   金谷重彦       



研究テーマ
  • メタボロームインフォマティクス
  • プロテオームインフォマティクス
  • トランスクリプトームインフォマティクス
  • 比較ゲノム



  • 略歴
  • 1981年  芝高校 卒業 陸上部(投擲)
  • 1985年  東京理科大学 理工学部 応用生物科学科卒
  • 1990年  豊橋技術科学大学 工学研究科 博士後期課程修了
  • 1990年  山形大学・工学部・情報工学科・助手
  • 1996年  山形大学・工学部・電子情報工学科・講師
  • 1996年  東京理科大学・生命科学研究所・研究員(客員)
  • 1996年  国立遺伝学研究所・生理進化部門・助教授(客員)
  • 1999年  山形大学・工学部・電子情報工学科・助教授
  • 1999年  山形県ライフサポートテクノロジー・環境科学推進委員
  • 2000年  山形大学・工学部・応用生命システム工学科・助教授
  • 2000年  (財)山形県企業振興公社生物ラジカル研究所・環境科学応用研(客員)
  • 2001年  奈良先端科学技術大学院大学・遺伝子教育センター・助教授
  • 2002年  奈良先端科学技術大学院大学・情報科学研究科・情報生命科学専攻・助教授
  • 2003年  理化学研究所・研究員(客員)(現在に至る)
  • 2004年〜 奈良先端科学技術大学院大学・情報科学研究科・情報生命科学専攻・教授(現在に至る)



  • 著書
    1. 阿部貴志、金谷重彦、木ノ内誠、池村淑道、自己組織化マップ(SOM):比較ゲノムと生物多様性研究への新規な情報学的手法、ゲノミクス・プロテオミクスの新展開(エヌ・ティー・エス出版)(印刷中)
    2. 大島拓、金谷重彦、大腸菌マイクロアレイ、ゲノミクス・プロテオミクスの新展開(エヌ・ティー・エス出版)(印刷中)
    3. 阿部貴志、金谷重彦、木ノ内誠、池村淑道、コドン使用と生産量との関連、生物工学ハンドブック(コロナ社)(印刷中)
    4. 金谷重彦、阿部貴志、木ノ内誠、池村淑道、ゲノム配列にひそむ特徴的なサインからみた生物多様性、ゲノムからみた生物の多様性と進化(シュプリンガー・フェアラーク東京)、pp.58-64 (2003)
    5. 金谷重彦、 福島敦史、森浩禎、渡辺良久、市場勇太 、池村淑道、ゲノム配列に潜む組織化された内部構造、数理科学(サイエンス社)、pp.25-31,6月号(2002)
    6. 森浩禎、堀内嵩、磯野克己、和田千恵子、金谷重彦、北川正成、荒武、大島拓、大腸菌のポストシーケンスゲノム解析、蛋白質核酸酵素(共立出版)、46, pp.1977-1985 (2001)
    7. S. Kanaya, T. Fukagawa, A. Ando, H. Inoko, Y. Kudo, T. Ikemura, Distribution of polypurine/polypyrimidine tract sequences in the human MHC region and their possible functions. Major Histocompatibility Complex, Evolution, Structure, and Function (Springer-Verlag Tokyo), pp.131-145 (2000)
    8. 金谷重彦、 池村淑道、 ゲノムと塩基組成. "ゲノム情報を読む", ネオ生物学シリーズ2 (共立出版), pp.18-35 (1997)



    原著論文 (~2000)
    1. S. Kanaya, Y. Ujiie, K. Hasegawa, T. Sato, H. Imada, M. Kinouchi, Y. Kudo, T. Ogata, H. Ohya, H. Kamada, K. Itamoto, K. Katsura, Proteome analysis of Oncorhynchus species during embryogenesis, Electrophoresis, 21, 1907-1913 (2000)
    2. M. Kinouchi, S. Kanaya, Y. Kudo, Detection of transfer RNA based on the cloverleaf secondary structure, J. Comput. Aided Chem., 1, 76-81 (2000)
    3. Y. Ujiie, K. Sasaki, M. Kinouchi, Y. Kudo, S. Kanaya, Prediction of proteolytic process based on N-terminal sequences and molecular weights by proteomics and proteome analysis, J. Comput. Aided Chem., 1, 82-88 (2000)
    4. M. Ohno, T. Tenzen, Y. Watanabe, T. Yamagata, S. Kanaya, T. Ikemura, Non-B DNA structures spatially and sequence-specifically associated with individual centromeres in the human interphase nucleus, Chromosomes Today, 13, 57-69 (2000)
    5. K. Nakayama, K. Takashima, H. Ishihara, T. Shinomiya, M. Kageyama, S. Kanaya, M. Ohnishi, T. Murata, H. Mori, T. Hayashi, The R-type pyocin of Pseudomonas aeruginosa is related to P2 phage, and the F-type is related to lambda phage, Mol. Microbiol., 38, 213-231 (2000)
    6. K. Nakayama, S. Kanaya, M. Ohnishi, Y. Terawaki, T. Hayashi, The complete nucleotide sequence of ?CTX, a cytotoxin-converting phage of Pseudomonas aeruginosa: implications for phage evolution and horizontal gene transfer via bacgteriophages, Mol. Microbiol., 31, 399-419 (1999)
    7. S. Kanaya, Y. Yamada, Y. Kudo, T. Ikemura, Studies of codon usage and tRNA genes of 18 unicellular organisms and quantification of Bacillus subtilis tRNAs: gene expression level and species-specific diversity of codon usage based on multivariate analysis, Gene, 238, 143-155 (1999)
    8. T. Kunisawa, S. Kanaya, E. Kutter, Comparison of synonymous codon distribution patterns of bacteriophage and host genomes, DNA Res., 5, 319-326 (1998)
    9. S. Kanaya, T. Okumura, H. Fukasawa, M. Miyauchi, Y. Kudo, Assessment of protein coding sequences in Bacillus subtilis genome using species-specific diversity of genes in codon usage based on multivariate analysis: comparison of the diversity between B. subtilis and Escherichia coli, Res. Commun. in Biochem. and Cell & Mol. Biology, 1, 82-92 (1997)
    10. S. Kanaya, Y. Kudo, K. Nakamura, T. Ikemura, Detection of genes in Escherichia coli sequences determined by genome projects and prediction of protein production levels, based on multivariate diversity in codon usage, CABIOS(Bioinformatics), 12, 213-225 (1996)
    11. Y. Nakamura, K. Wada, Y. Wada, H. Doi, S. Kanaya, T. Gojobori, T. Ikemura, Codon usage tabulated from the international DNA sequence databases, Nucleic Acids Res., 24, 214-215 (1996)
    12. S. Kanaya, Y. Kudo, S. Moki-Toda, K. Katsura, C. Del Carpio, Synchronous gene expressions during embryogenesis of Oncorhynchus masou (YAMAME), Biochem. and Mol. Biol. International, 39, 261-266 (1996)
    13. S. Kanaya, Y. Kudo, Genome propensities of Escherichia coli and elevencoliphages for under- and overabundance of ?70-consensus-like sequences, Int. J. Genome Res., 1, 261-277 (1994)
    14. S. Kanaya, Y. Kudo, Statistical examination of dissimilarity of promoter and promoter-like sequences in Eshcherichia coli, Anal. Sci., 7, 739-742 (1991)
    15. H. Abe, S. Kanaya, T. Komukai, Y. Takahashi, and S. Sasaki, Systematization of semantic descriptions of odors, Anal. Chim. Acta, 239, 73-85 (1990)
    16. H. Abe, S. Kanaya, Y. Takahashi, S. Sasaki, combined semiconductor gas sensor system for detection of specific substances in particular environments, Anal. Chim. Acta, 219, 213-222 (1989)
    17. Y. Miyashita, S. Kanaya, H. Katsumi, C. Takayama, A., Nagakura, and S. Sasaki, Structure-taste correlation of substituted beta-(3-hydroxy-4- Methoxypheynyl) ethylbenzenes using pattern recognition method, Chem. Senses, 14, 781-792 (1989)
    18. H. Abe, S. Kanaya, Y. Takahashi, and S. Sasaki, Method for monitoring sensor stability in a multiple semiconductor gas-sensor system, Anal. Chim. Acta, 225, 89-96 (1989)
    19. T. Okuyama, Y. Miyashita, S. Kanaya, H. Katsumi, S. Sasaki, M. Randic, Computer assisted structure-taste studies on sulfamates by pattern recognition method using graph theoretical invariants, J. Comput. Chem., 9, 636-646 (1988)
    20. H. Abe, S. Kanaya, T. Takahashi, S. Sasaki, Extended studies of the automated odor-sensing system based on plural semiconductor gas sensors with computerized pattern recognition techniques, Anal. Chim. Acta, 215, 155-168 (1988)
    21. H. Abe, T. Yoshimura, S. Kanaya, Y. Takahashi, Y. Miyashita, S. Sasaki, Automated odor-sensing system based on plural semiconductor gas sensors and computerized pattern recognition, Anal. Chim. Acta, 194, 1-9 (1987)



    受賞歴
    1. 第5回進化学会ベストポスター賞、自己組織化法に基づいた生物種固有のオリゴヌクレオチド組成によるゲノム多様性の解明(2003)
    2. 第3回CBI学会大会優秀論文賞、スペクトル解析によるゲノムの周期性とその比較(2002)
    3. 第22回情報化学討論会ベストポスター賞、学習順に依存しない自己組織化法の開発(1999)





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